Европейское бюро по борьбе с мошенничеством начало расследование в отношении Далли после жалобы табачной компании Swedish Match. Компания заявила, что некий мальтийский бизнесмен пытался заработать на своем знакомстве с еврокомиссаром, также уроженцем Мальты. Бюро не нашло убедительных доказательств прямого участия Далли в деятельности бизнесмена, но постановило, что комиссар «был в курсе этих событий». Далли отрицает свою причастность. Согласно жалобе Swedish Match, бизнесмен предложил оказать влияние на Далли при рассмотрении запрета на экспорт из ЕС снюса — традиционного шведского табачного изделия, который употребляют, помещая на длительное время в рот между губой и десной.
Европейский комиссар по вопросам здравоохранения и защиты прав потребителей Джон Далли ушел в отставку на фоне обвинений, связанных с «торговлей влиянием» в табачном бизнесе.