Генетики из Великобритании впервые расшифровали полный геном карликовой березы.
Ученые надеются понять, почему эти березы и их «большие» сестры не способны противостоять набегам жуков-узкозлаток, проникших в Европу и Азию из Северной Америки.
Как отметил один из авторов открытия Джеймс Боррелл из университета Королевы Марии в Лондоне, полученный геном важен для сохранения популяции берез в стране.
Группа генетиков под руководством Ричарда Баггса расшифровала геном карликовой березы, пытаясь найти генетические корни эпидемии бронзовых узкозлаток в европейских березовых рощах.
Эти насекомые питаются корой и другими частями ствола берез. Европейские и азиатские березы не обладают устойчивостью к ним, и их проникновение на территорию Британии и других европейских государств стало причиной настоящей экологической катастрофы.
Баггс и его коллеги собрали образцы клеток березы в северных районах Шотландии, извлекли из них генетический материал и расшифровали его. В общей сложности геном карликовой березы содержит в себе 450 миллионов нуклеотидов — «букв» ДНК.
По своему качеству виртуальный геном березы не уступает аналогичным последовательностям для человека и других организмов. Каждый нуклеотид был в среднем прочитан 67 раз, что минимизирует число возможных ошибок при секвенировании генома.
Исследователи провели черновое исследование генома и выделили в нем несколько подозрительных участков, которые могут влиять на способность березы защищаться от нападений узкозлаток.
Далее ученые планируют сравнить их с аналогичными фрагментами в геномах 15 других видов берез, и найти причину уязвимости.